单细胞

单细胞免疫组测序(10x 5')
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10x Genomics认证单细胞测序联合实验室




背景简介


        T淋巴细胞(T cell)和B淋巴细胞(B cell)主要负责适应性免疫应答,其抗原识别主要依赖于T细胞受体(T cell recptor, TCR)和B细胞受体(B cell recptor, BCR),这两类细胞表面分子的共同特点是其多样性,可以识别多种多样的抗原分子。BCR的轻链和TCRβ链由V、D、J、C四个基因片段组成,BCR的重链和TCRα链由V、J、C三个基因片段组成,这些基因片段在遗传过程中发生重组、重排,组合成不同的形式,保证了受体多样性。

        传统免疫组库研究方式局限性较大,10x Genomics新推出的“单细胞免疫谱分析”利用其微流控芯片制备单细胞体系,选择5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行V(D)J富集,实现在单细胞水平,对成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)进行全长测序,为免疫组库全面、系统的研究提供了高效的技术平台,对疾病发生、发展的分子机制研究有重要的意义。


 


 





技术优势

 
1.可实现成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)的全长测序
2.精细到单细胞水平,能获得大量单细胞的免疫组库数据

3.大规模单细胞VDJ+表达谱测序,单个细胞成本大大降低 








 


  

技术路线


 


 




 


分析内容



   






样本类型


样本类型

样本量及保存条件

实体组织

0.2g(参考⻩⾖粒:0.5 cm2⼤⼩),组织样本于充满预冷组织保存液(免费提供)的螺⼝冻存管中,密封后于 2~8℃ 保存/运输;

⾎液,骨髓类样本

2mL ,4-8℃保存运输,⾎液样本尽量在 ⼩时内进⾏有核细胞分离,最长不超过 12 ⼩时。

积液类样本,腹⽔,胸腔积液,膝盖积液,淋巴液,灌洗液和脑脊液等样本

5mL ,取样后置于 4-8℃ 环境进⾏保存运输


 






代表性文章

ElhamAzizi, et al. Single-Cell Map of Diverse Immune Phenotypes in the Breast Tumor Microenvironment. Cell, 2018,DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.05.060