单细胞

FFPE单细胞转录组测序
  • 产品介绍
  • 案例展示
  • 结果展示
  • 常见问题

产品介绍

FFPE单细胞测序技术是基于随机引物的单细胞全长转录组扩增技术,能够实现对RNA非完整样本的转录本进行扩增,该技术非常适用于FFPE标本的单细胞检测。由于是随机引物的扩增方式,对于物种没有限制,原则上任何物种采用FFPE保存的标本,均可以采用该方式进行单细胞转录本的检测!








技术优势

1. 全物种覆盖:囊括人类、动物、植物等真核生物细胞

2.样本兼容性高:新鲜组织、冻存组织和FFPE组织

3. 极高灵敏度:随机引物扩增极大提高了基因检出数

4.全长转录组覆盖3’到5’的全长转录本覆盖

 





数据指标展示








技术路线








分析内容






样本要求

样本类型

样本量

石蜡块

被包埋组织体积需>0.5cm3(参考黄豆粒大小)常温4℃运输

石蜡卷

可切石蜡卷2-3卷,每卷厚度~50µm将石蜡卷放入1.5 mL EP管中,常温或者冰袋4℃运输

备注:切片太薄容易导致细胞数量少,并且有可能使细胞核破碎。样本细胞数量少可以提供多一些石蜡卷






应用方向

1.肿瘤学(肿瘤微环境;肿瘤异质性;肿瘤浸润)

2.免疫学(免疫细胞浸润;免疫扩散)

3.生长发育(细胞类型的空间分布)

4.神经系统发育




代表性文章

Xu Z, et al. High-throughput single nucleus total RNA sequencing of formalin-fixed paraffin-embedded tissues by snRandom-seq. Nat Commun. 2023 May 12;14(1):2734. doi: 10.1038/s41467-023-38409-5. PMID: 37173341; PMCID: PMC10182092.