产品介绍
FFPE单细胞测序技术是基于随机引物的单细胞全长转录组扩增技术,能够实现对RNA非完整样本的转录本进行扩增,该技术非常适用于FFPE标本的单细胞检测。由于是随机引物的扩增方式,对于物种没有限制,原则上任何物种采用FFPE保存的标本,均可以采用该方式进行单细胞转录本的检测!
技术优势
1. 全物种覆盖:囊括人类、动物、植物等真核生物细胞
2.样本兼容性高:新鲜组织、冻存组织和FFPE组织
3. 极高灵敏度:随机引物扩增极大提高了基因检出数
4.全长转录组覆盖:3’到5’的全长转录本覆盖
数据指标展示
技术路线
分析内容
样本要求
样本类型 |
样本量 |
石蜡块 |
被包埋组织体积需>0.5cm3(参考黄豆粒大小),常温或4℃运输 |
石蜡卷 |
可切石蜡卷2-3卷,每卷厚度~50µm,将石蜡卷放入1.5 mL EP管中,常温或者冰袋4℃运输 备注:切片太薄容易导致细胞数量少,并且有可能使细胞核破碎。样本细胞数量少可以提供多一些石蜡卷 |
应用方向
1.肿瘤学(肿瘤微环境;肿瘤异质性;肿瘤浸润)
2.免疫学(免疫细胞浸润;免疫扩散)
3.生长发育(细胞类型的空间分布)
4.神经系统发育
代表性文章
Xu Z, et al. High-throughput single nucleus total RNA sequencing of formalin-fixed paraffin-embedded tissues by snRandom-seq. Nat Commun. 2023 May 12;14(1):2734. doi: 10.1038/s41467-023-38409-5. PMID: 37173341; PMCID: PMC10182092.