背景简介
研究人员早已在肿瘤内发现了细菌的存在，但因其生物量低，全面描述肿瘤微生物组的特征极具挑战性。肿瘤内的细菌已被发现具有肿瘤特异性，并且已有的机制研究表明，肿瘤内微生物群可能直接调节肿瘤的发生、发展，以及对化疗或免疫治疗的应答。2020年两项重量级的肿瘤内微生物组研究相继在Nature和Science上发表，标志着研究人员可以借助高通量测序技术对肿瘤内的微生物组开展全面且深入地研究，更进一步地揭示微生物在肿瘤中的作用。
联川生物肿瘤微生物组检测项目汲取最新的研究成果和检测技术，采用5R 16S测序，即对16S rRNA基因上的五个区域进行多重PCR扩增和测序，有效降低了组织中宿主DNA对细菌16S rDNA扩增的严重干扰，同时配合专用的污染菌过滤流程，助力研究人员全面真实地阐释肿瘤组织内微生物组的特征和功能。该技术也适用于其他微生物含量低但宿主占比高的样本中的菌群检测。
联川优势
采用创新的5R 16S测序技术对肿瘤组织内低丰度菌群进行鉴定，大幅提高菌群检出率
采用创新的5R 16S测序技术可以鉴定菌群到种水平
采用创新的5R 16S测序技术可以鉴定降解的FFPE样本中的菌群
独有的从实验到数据分析（含过滤污染菌）的成熟的肿瘤微生物组流程体系
拥有上万例数十类不同肿瘤组织样本的菌群检测成功经验，已协助用户发表多篇10分+文章
技术路线
分析内容
1. 原始数据质量控制与过滤
2. 5R16S数据专有整合分析
3. 菌群鉴定与相对丰度计算
4. 污染菌鉴定与过滤
5. 菌群多样性分析
6. 差异菌群分析
7. 菌群功能预测
样品类型
组织、FFPE、DNA等
建议总DNA起始量：1 μg，最低200 ng，浓度≥10 ng/μL