1.1背景介绍
4D蛋白质组是新一代蛋白质组学分析技术， 由布鲁克公司与蛋白质组学领域的领军人物Matthias Mann， Ruedi Aebersold， Jürgen Cox ， Ben Collins和Hannes Roest等科研团队合作推出的技术。4D-Proteomics™： 在传统保留时间（retention time）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity） 的基础之上增加了第四维的离子淌度（mobility）的分离。4D label free/DIA蛋白组鉴定能力提高50%以上,对比常规的 label free/DIA具有鉴定数更多、样本量需求更少、鉴定更精准的。
1.2技术优势
蛋白鉴定数目更多、需要样本量更少（200ng）、覆盖度较高、鉴定更精准
1.3技术路线
1.4 分析内容
1）数据质控；
2）差异蛋白筛选根据p value和FC筛选具有显著差异的蛋白；
3）火山图、聚类热图；
4）感兴趣蛋白的分布或表达的可视化展示；
5）GO、KEGG功能分析和通路分析，富集和差异蛋白改变相关的通路和功能进一步研究；
6) PPI分析等。