背景介绍
细胞的转录信息、空间位置信息、形态学信息、生理学信息，对理解细胞功能至关重要。空间转录组技术实现在组织环境中将基因表达情况可视化。
联川空间转录组测序是利用10X Genomics Visium平台，结合显微成像、芯片、测序技术，从一片完整的冰冻组织切片中获取切片不同位置细胞中转录组数据，并将组织学和基因表达分析相结合，通过特有数据分析方法进行基因表达和形态学数据的可视化。
技术优势
1.在国内领先搭建了空间转录组测序服务平台
2.处理上百例样本类型，经验丰富
3.物种涵盖广
4.研发了特殊组织透化方法，包括致密组织透化法、黏膜组织透化法、结缔组织透化法等
技术路线
组织包埋—切片制备—H&E染色和显微成像—组织透化—细胞标记和cDNA合成—文库构建—测序—数据分析
分析内容
样本类型
新鲜组织进行OCT包埋处理后冷冻寄送；
如无法立即进行OCT包埋处理，可先用异戊烷速冻后再冻存，后期包埋后寄送
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应用方向
1.肿瘤研究（肿瘤微环境、肿瘤异质性、肿瘤浸润）
2.免疫研究（免疫细胞浸润、免疫扩散）
3. 发育生物学（细胞类型的空间分布）
4.神经学（大脑图谱、脑组织解剖）
5.病理学（病理切片的、空间基因表达信息）
代表性文章
Moncada R, et al. Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq reveals tissue architecture in pancreatic ductal adenocarcinomas. Nat Biotechnol. 2020 Mar;38(3):333-342. doi: 10.1038/s41587-019-0392-8. Epub 2020 Jan 13. Erratum in: Nat Biotechnol. 2020 Dec;38(12):1476. PMID: 31932730.