产品介绍
10x Visium CytAssist FFPE空间转录组采用探针法进行基因的杂交和表达检测,目前仅适用人、小鼠物种的FFPE样本。其中人有18000个基因的探针;小鼠有20000个基因的探针。FFPE表达芯片尺寸有6.5*6.5mm,11*11mm两种尺寸。
技术优势
1.样本兼容性高:样本兼容性扩展到贴有切片的载玻片
2.保存形式多样:DV200的质控要求降为>30%,允许检测更多长期保存的高度降解的样本
3.捕获面积更大:新增加了11mm * 11mm捕获区域
4.基因检出率极高:三对探针对同时捕获
5.样本前处理简化:组织粘附性更高,无需复杂的预实验
技术路线
分析内容
样本要求
样本类型(人和小鼠) |
送样要求 |
石蜡块 |
石蜡块建议厚度2-5mm。常温或4℃运输 |
石蜡包埋的白片(切好的石蜡卷需要贴在玻片上)和贴片 |
白片需要贴在玻片上或贴片建议准备6-13片(5um厚度),封装好(可放置在玻片盒中)常温或4℃寄送至联川生物实验室。 |
已保存的玻片 |
已保存在玻片上的样本建议准备6-13片(5um厚度),封装好(可放置在玻片盒中)常温或4℃寄送至联川生物实验室。 |
OCT包埋块 |
提供新鲜组织的OCT包埋块或者是4% PFA中固定在4度12小时内,取出,擦干组织,做OCT冰冻包埋,建议组织大小为长×宽不超过6.5mm×6.5mm,高度≥5mm,封装好干冰寄送至联川生物实验室。 |
应用方向
病理学;肿瘤学;免疫学研究;神经学研究;发育生物学
代表性文章
Meylan M, et al. Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer. Immunity. 2022 Mar 8;55(3):527-541.e5. doi: 10.1016/j.immuni.2022.02.001. Epub 2022 Feb 28. PMID: 35231421.