产品介绍
华大时空组学(Stereo-Seq)是一种基于DNA纳米球研发的产品,以时空芯片捕获组织样本中的mRNA,并进一步的采用时空条形码还原组织样本的空间位置信息,实现组织原位测序。
技术优势
1.创新的单片组织切片染色方法,实现在同一切片上进行病理学和时空组学的研究
2.分米级的时空芯片和纳米级的DNB探针实现超高分辨率、大视场的原位全景式技术
3.可以实现同一样本在组织、细胞、亚细胞、分子“四尺度”
4.样本兼容性极高,可实验对新鲜冷冻保存的动植物全物种的空间组学测序
技术路线
分析内容
样本要求
样本类型 |
样本要求 |
OCT包埋组织 |
1. H&E染色:样品切面的形貌符合预期,无明显冰晶、裂纹,无细胞坏死。 2. RNA完整性检测:提取组织RNA,测得RIN值≥7 |
应用方向
肿瘤研究;免疫研究;发育生物学;脑神经学;病理研究
代表性文章
Ou Z, et al. Single-Nucleus RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal the Immunological Microenvironment of Cervical Squamous Cell Carcinoma. Adv Sci (Weinh). 2022 Oct;9(29):e2203040. doi: 10.1002/advs.202203040. Epub 2022 Aug 19. PMID: 35986392; PMCID: PMC9561780.