免疫组TCR _BCR测序样本送样指南
免疫组 RNA 测序样本类型:全血、组织、PBMC、分选细胞、RNA
免疫组 DNA 测序样本类型:全血、组织、PBMC、分选细胞、DNA、FFPE
1.全血样本
推荐使用 EDTA 或 ACD 抗凝的采血管(一定不能使用肝素抗凝,肝素严重影响下游建
库工作)收集外周血样品,需 5mL 左右。新鲜全血样品 4℃保存,冰袋运输,2-3 天内寄达,
勿冻。
注意事项:①考虑每个病人血液中淋巴细胞数量不同,且 T 细胞含量不同,为确保样品足量有效, 故要求血样量不能低于 5mL。
②全血样本尽量当天采集当天寄出,最晚 3-5 天内需要处理。
③采用 RNA+5RACE 的建库方法,RNA 上样量常规使用 3μg,若无法达到 3μg,根据 浓
度和体系上样本最大量,最低需要 1μg。
④全血样本不建议直接冻存,因为冻融过程中会死掉大量细胞,影响核酸提取,尤其会
影响 RNA 的降解。
2. 组织样本
新鲜手术或穿刺组织 5mg 以上,
①迅速放入到液氮中(适合 DNA 或 RNA 提取), -80℃保存,干冰运输;
②迅速放到RNAlater保存液中,需浸没组织,冰袋运输即可。
注:①组织样本内不确定 T/B 细胞含量,且分布不均,无法保证结果,新鲜组织样本首选
建议处理成单细胞悬液样本后送样(细胞数量要求≥ 1×106个细胞)。
②采用 RNA+5’RACE 的建库方法,RNA 上样量常规使用 3μg,若无法达到 3 μg,根据浓度
和体系上样本最大量,最低需要 1μg。
3. FFPE 样品
FFPE 送样要求:5-10 白片,常温运输
注:FFPE 仅能提取 DNA。DNA 上样量常规使用 3ug,若无法达到 3ug,根据浓度和体系上 样
本最大量。
4. PBMC 样品
提取 PBMC,细胞数量要求≥ 1×106个细胞。 送样方法:
①将细胞保存于 Trizol 中(适合 RNA 提取)。步骤:向细胞沉淀中加入 trizol,每
1×105—1×107个细胞加 0.5-1mL即可,再吹匀打散,确保细胞充分接触, -80℃保存,干冰
运输寄送。
②将细胞保存于细胞冻存液(适合 DNA 或 RNA 提取)中,可使用的细胞冻存液有如下选
择类型: 市面上销售的成品细胞冻存液或自制细胞冻存液(冻存液常规配比为培养基:血
清:DMSO=7:2:1,如果细胞比较珍贵,可以调整为血清:DMSO=9:1), -80℃保存,干冰运
输寄送。
注意事项:采用 RNA+5RACE 的建库方法,RNA 上样量常规使用 3μg,若无法达到 3ug,根据浓 度 和体系上样本最大量,最低需要 1ug。
5. 冻存分选细胞
需提供分选好的细胞,细胞数量要求≥ 2×105 个细胞。 送样方法: 同上PBMC样本
6. 微量分选新鲜细胞(注:仅限同城。)
体积>50μL(PBS溶剂),细胞浓度>100 个/μL,细胞数量要求≥5×103个细胞。
送样方法:运输过程中保持管子竖立状态,不要倒,确保细胞保存于液体中,另外,确保液体中只有 PBS 这一种溶剂,4℃运输,并且在当天送达实验室
7. RNA 样品要求及送样建议
总 RNA 量>1μg,RNA 体积>20μL(含 5-7μL用于质检),浓度等其它要求如下:
将 RNA 样品转移至洁净 1.5mL EP 管,-80℃保存,干冰运输。
8.DNA 样品要求及送样建议
总 DNA 量>1μg,DNA 体积>20μL(含 2ul 用于质检),浓度等其它要求如下:
将 DNA 样品转移至洁净 1.5mL EP 管,-80℃/-20℃保存,干冰运输。
注意事项:
a. 实验上样量基本要求: DNA 量常规一般使用 3μg(如达不到,就按送样量加,最低量要
求 100ng)。
b. 组织及细胞中 DNA 质检浓度要求依据实验室检测经验而定;
c. 石蜡包埋样本(1)合格标准:限于石蜡样本质量因素,提取 DNA 达不到常规样本要求质量(70ng/μL),为能对更多样本做此项目检测,故降低标准;风险标准:限于石蜡样本质量因素,最低要求,是比常规样本浓度要求要高,进而才能做此项目检测。
9.其它物种,样品要求及送样建议
1. 小鼠一般采集至少 200μl 左右的抗凝外周血,裂红处理,PBS 洗一至两遍,弃上清,细胞
沉淀加 500ul 的 Trizol,涡旋混匀后-80 冻存(可以在混匀后加一步液氮速冻,之后再-80
冻存),干冰寄送。
