植物内生菌多样性测序样本送样指南
1. 植物内生菌
1) 根据研究选取新鲜植物组织(2~5 g),用无菌水清洗除去植物样本表面的杂物。
2) 再依次用70%无水乙醇和2.5%次氯酸钠,浸泡 40 s 和 10 min,每 100 mL 2.5%次氯酸钠加一滴吐温80。
3) 无菌水清洗2-3 次,至消毒液彻底去除,最后用灭菌滤纸将水分吸干。将组织置于液氮速冻 1 h 以上,转至-80 ℃保存。
4) 如条件允许,可取最后一次漂洗液涂布于平板以检测表面消毒是否彻底。
2. 根表面菌
1) 将所研究的样本放在无菌容器当中,加入PBS 缓冲液(完全淹没样本)后进行振荡。
2) 使得微生物从根表面充分的脱落 并聚集在 PBS 缓冲液当中,震荡至少 2 h 以上。
3) 将缓冲液用 0.22 μm 滤膜过滤,将滤膜装入合适的冻存管液氮速冻 1 h 以 上,转至-80 ℃保存。
3. 叶外生菌
1) 用灭菌剪刀裁剪得到等重量的叶片,置于装有 PBS 缓冲液的无菌离心管中静置一段时间,离心去上清液,加1 mL 缓冲液重悬,液氮速冻,置于-80℃保存。
2) 若样本量大,可用无菌医用棉签 2 至3 根经缓冲液湿润后在叶表面擦拭,后在装有磷酸盐缓冲液的离心管中搅动,离心去上清,再用 1 mL 缓冲液重悬,液氮速冻1 h 以上,转至-80 ℃保存。
4. 茎外生菌
对植物茎片段使用无菌水振荡(或超声波)洗涤多次,收集洗涤液以 0.22 μm 滤膜过滤,将滤膜装入合适的冻存管液 氮速冻 1 h 以上,转至-80 ℃保存。
