蛋白与代谢组学

蛋白修饰组学
  • 送样建议

一、各类样本的推荐送样量

1. 动物组织

1)常规动物组织

磷酸化修饰:单份>30 mg

酰化类修饰(乳酸/泛素/乙酰/琥珀酰化):单份>100 mg

2)坚硬组织(软骨、毛发):暂不接收

2. 植物组织

1)柔软植物组织(叶片、花瓣等)

磷酸化:>600 mg

酰化修饰:>5 g

2)坚硬植物组织(根、树皮、枝条、果实、种子)

磷酸化:暂不接收

酰化修饰:>10 g

3.微生物(细菌、真菌菌体沉淀)

磷酸化:菌体沉淀体积>50 μL

酰化修饰:菌体沉淀体积>500 μL

4.培养细胞(贴壁/悬浮细胞

磷酸化:≥5×10⁶个细胞,或50 μL细胞沉淀

酰化修饰:≥2×10⁷个细胞,或200 μL细胞沉淀(约8盘10 cm培养皿细胞量)

5.液体类样本(淋巴液、关节液、唾液、乳汁、腹水等)

磷酸化:单份>1 mL

酰化修饰:单份>50 mL

重要说明:血浆、细胞上清目前暂不开展修饰组检测,不接收。

6.蛋白溶液(已提取好的总蛋白)

磷酸化:蛋白总量>600 μg

酰化修饰:蛋白总量>4 mg

二、样本保存与运输要求

1.样本离体后立即液氮速冻,全程添加蛋白酶抑制剂、去修饰酶抑制剂,防止蛋白降解、修饰基团丢失;

2.长期存放置于-80℃超低温冰箱,严禁反复冻融;

3.寄送全程干冰低温运输,保证样本不解冻。

三、样本质控与预处理要求

1.动物/植物组织:剔除脂肪、结缔组织、木质化杂质,切碎后速冻;

2.细胞样本:弃培养基,PBS清洗2–3次,离心收集细胞沉淀后速冻;

3.液体样本:去除细胞碎片、油脂杂质,分装速冻;

4.坚硬组织(软骨、毛发)不建议送样,磷酸化修饰不接收木质化植物硬组织。