10x Genomics认证优选服务商
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10x Genomics认证单细胞测序联合实验室
产品简介
单细胞RNA-seq(scRNA-seq)已经成为探究复杂组织中细胞类型、分子变化和细胞功能的重要手段。然而，单细胞技术要求从新鲜组织中制备单细胞悬液，获得较高的细胞活性和细胞质量，而-80度冰箱海量的冻存样本因为无法制备高质量细胞悬液而无法应用于单细胞测序，这是限制单细胞技术广泛应用的主要障碍。为了解决冻存样本的单细胞应用问题，研究人员开发了单细胞水平上的核转录组测序（snRNA-seq），被证明是较好的技术方案。
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分析内容
样本类型
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样本类型 |
样本量及保存条件 |
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组织样本 |
新鲜组织样本：≥0.2g（参考⻩⾖粒：0.5 cm2⼤⼩），组织样本于充满预冷组织保存液（免费提供）的螺⼝冻存管中，密封后于 2~8℃ 保存/运输； 冻存组织样本：≥0.2g（参考⻩⾖粒：0.5 cm2⼤⼩），放入冻存管，液氮速冻2小时以上（必需要液氮速冻），继续放在液氮罐或-80℃冰箱冻存。如条件允许，建议在液氮罐中保存，干冰运输 新鲜细胞样本：≥3×105；细胞状态良好，杂质含量低，细胞活率好，无污染，细胞培养于培养瓶中，在运输前灌满培养基，室温运输； 冻存细胞样本：细胞用PBS 洗涤，4℃、300g离心5min，小心吸去全部液体后，使用细胞冻存液冻存细胞后（梯度冻存），干冰运输。 |
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植物类样本 |
≥1g，建议原始的培养条件活体寄送；条件不允许的情况下，可以寄送冻存样本 |
冻存样本snRNA-seq的应用现状
代表性文章
Slyper M, et al. A single-cell and single-nucleus RNA-Seq toolbox for fresh and frozen human tumors. Nat Med. 2020 May;26(5):792-802. doi: 10.1038/s41591-020-0844-1. Epub 2020 May 11. Erratum in: Nat Med. 2020 Jun 25;: PMID: 32405060; PMCID: PMC7220853.