产品简介
染色质的三维空间结构是基因表达调控的核心环节，解析其组织规律及功能机制是表观遗传学的重要研究方向。Hi-C（高通量染色体构象捕获） 作为 3D 基因组研究的里程碑技术，由美国 Job Dekker 团队于 2009 年首次提出，能够实现全基因组范围内 DNA 互作的无偏检测，目前已广泛应用于人类、动植物及微生物等各类物种的研究中。
该技术通过甲醛固定、酶切、近端连接、高通量测序及生物信息学分析，系统绘制全基因组染色质的空间互作图谱，精准识别远程调控元件，揭示基因表达的三维调控机制。
Hi-C 技术的核心应用方向包括：
（1）解析基因组层级结构（区室、拓扑关联结构域、染色质环），阐明空间构象调控基因转录的分子机制；
（2）结合 WGS、RNA-seq、ATAC-seq、CUT&Tag 等多组学技术，深入挖掘疾病与癌症发生发展的三维基因组基础；
（3）对比不同发育阶段或外界刺激下的染色质构象变化，揭示生命过程中基因组三维结构的动态调控规律。
样本要求
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样本类型 |
样本量及保存条件 |
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动物细胞系 |
10^6~10^7个/管，建议备1管备份；确保细胞生长良好无支原体污染推荐：加冻存液（10%DMSO+90%FBS）梯度/程序降温至-80℃；细胞沉淀少时冻存液减至200μL可选：PBS清洗后直接液氮速冻若自行甲醛交联：按步骤处理后液氮速冻-80℃保存，送样务必备注已交联 |
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动物血液 |
哺乳动物≥3mL，非哺乳动物≥1mL EDTA抗凝管采集（禁用肝素），液氮速冻或-80℃保存；同城可冰袋运输当天送达 |
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动物组织 |
≥0.5g，建议备1管备份新鲜组织剔除杂质，PBS/生理盐水冲洗吸干后，立即液氮速冻，-80℃保存优先推荐心肝脾肺肾、脑、肌肉等；皮肤、脂肪、肠道等组织实验难度大 |
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植物组织 |
≥1g，建议备1管备份取新鲜幼嫩、生长旺盛组织，无菌水冲洗吸干后，立即液氮速冻，-80℃保存 |
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微生物单菌 |
≥10^9个/管，建议备1管备份收集对数生长期菌体（勿用平台期/衰老期），PBS清洗离心后，立即液氮速冻，-80℃保存 |
技术路线
分析内容
技术优势
1.全基因组无偏互作检测：实现全基因组 "all-versus-all" 无偏染色质互作分析，一次性覆盖从染色体间互作到精细染色质环的全层级三维结构，是 3D 基因组研究的金标准技术。
2.广泛的物种与样本兼容性：支持人类、动物、植物、微生物等几乎所有真核及原核生物，适配细胞系、血液、实体组织等多种样本类型，成熟技术可兼容部分固定样本，充分利用临床及样本库资源。
3.精准的空间调控机制解析：可系统鉴定 A/B 区室、拓扑关联结构域（TAD）、远程增强子 - 启动子互作等关键调控元件，直接揭示基因组空间构象调控基因表达的分子机制。
4.强大的多组学整合能力：可与 WGS、RNA-seq、ATAC-seq、CUT&Tag 等多组学技术无缝联合，深度解析发育分化、疾病发生、物种进化等生物学过程，支持多样本动态差异与比较分析。
应用方向
1. 肿瘤学 (染色质结构异常；癌基因激活机制；肿瘤克隆进化)
2. 免疫学 (免疫细胞分化；免疫应答调控)
3. 发育生物学 (胚胎发育的三维调控)
4. 神经系统发育
5. 遗传学 (基因组组装；顺式调控元件；三维结构注释)
6. 进化生物学 (物种保守性分析；染色体重排演化)
7. 复杂疾病 (遗传疾病致病机制)