简介
CUT&Tag全称Cleavage Under Targets and Tagmentation,是蛋白-DNA 互作的一大革新技术,该技术核心为 Hyperactive pG-Tn5/pA-Tn5 Transposase,该酶是将Protein G/A 与经过工程学改造的超高活性 Tn5 转座酶进行融合,形成同时具备转座酶与 Protein G/A活性的新型融合酶,专门适用于蛋白质-基因组互作研究的CUT&Tag技术核心酶,可以在切割DNA片段的同时在序列两端加上测序接头,经PCR扩增后形成可以直接用于高通量测序的文库。CUT&Tag技术与CHIP-seq类似可在基因组范围内检测组蛋白、RNA polymerase II 和转录因子等蛋白质结合的DNA区域,应用于临床和科研的表观遗传学研究。
生物信息学分析流程与分析内容
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联川优势
多篇用户文章登顶TOP期刊
采用顶级期刊高频分析流程,可提供几十套标准及个性化分析服务
几十款抗体测试数据,为后续高质量数据呈现保驾护航
丰富的售后和审稿意见处理经验
项目流程图
联川生物CUT&Tag测序可以为研究人员提供从样本准备、免疫共沉淀(IP)、建库测序、数据分析等一系列完整的服务流程,提供高质量的数据结果,并为后续研究提供强有力的参考依据。
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样本起始量与送样建议
样本类型
起始量
原代细胞/细胞系
>1×105个
细胞活率>80%(90%以上更佳),有核率>70%,无明显杂质
动物及临床脏器组织/脑组织等
>100mg
植物根/茎/叶等
>1g
注意事项:
① ATAC-seq/CUT&Tag 等涉及 Tn5 酶的项目被支原体污染后对数据结果影响极大,因此在收集细胞时须进行支原体检测,保障样品无支原体污染。
② IP富集每种样本的富集效率有比较大的差别,所以有条件的话尽量多准备一些样本并做好备份。对于一些特殊样本,比如动物组织中的皮肤,软骨等,植物中多糖含量比较高样本等,请联系技术人员确认送样细节;
③ IP实验的成功与抗体直接相关,请选用商业化ChIP级别抗体,并提供与一抗种属来源对应的二抗,每个样本每个指标>10μL。
④ 更加详细的样本准备指南,请发送邮件至 market@lc-bio.com 索要或联系驻地销售。
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[4] Deng S., et al. (2022) RNA m6A regulates transcription via DNA demethylation and chromatin accessibility. Nature Genetics.
[5] Chen T., et al. (2021) WDR5 facilitates EMT and metastasis of CCA by increasing HIF-1a accumulation in Myc-dependent and independent pathways. Molecular Therapy.
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