背景简介
扩增子测序常用于微生物群落的多样性分析。16S rDNA测序(v3-v4)和ITS测序(ITS2)常分别用于细菌群落和真菌群落的多样性分析。联川生物的扩增子测序数据分析已全面使用QIIME 2流程,不再使用传统的基于OTU的分析方法,调用DADA2对原始数据进行去噪,相当于按照100%的相似性聚类,进而获得单碱基精度的代表序列,结果更丰富,更真实的还原微生物群落结构。
联川优势
检测体系稳定可靠:从自动化核酸提取到自动化建库,到Novaseq PE250测序,再到QIIME 2分析流程,最终客观还原菌群组成,找到核心菌,并预测菌群功能;
样本处理经验丰富:累计处理过30万+各种来源的样本,并成功开展菌群检测;
持续助力文章发表:累计助力用户发表微生物组文章超过500篇,10分+文章近百篇,月均新发表用户文章约10篇。
技术路线
分析内容
样本类型
粪便、唾液、灌洗液、分泌物、拭子、水体、土壤、根际土、空气、DNA等。
建议总DNA起始量≥ 100 ng,最低10 ng。