背景介绍
Orbitrap™ Astral™ 质谱系统可实现8分钟,8000个蛋白的鉴定深度,标志着蛋白质组学质谱,从低频率高分辨时代,迈入了高频率高分辨时代。Orbitrap™ Astral™ 高分辨质谱仪,同时搭载三种质量分析器:四极杆质量分析器、 Orbitrap™ 和 Astral™,检测能力达到了前所未有的高度。
联川生物提供 Astral-DIA(8min)、 Astral-DIA(24min)等个性化上机时间的Astral蛋白检测。
技术优势
1.高通量
检测速度快:Astral-DIA技术能够在短时间内完成大量样本的分析研究
2.深覆盖
高蛋白鉴定深度:Astral-DIA技术能够鉴定更多的蛋白质和肽段。
3.精准定量
高灵敏度:OrbitrapAstral质谱仪的灵敏度极高,能够检测到低丰度蛋白质。其动态范围可达5个数量级,能够准确检测从高丰度到低丰度的蛋白质。
4.高稳定性
重复性高:Astral-DIA技术采用“窗口”数据采集方式,减少了数据采集的随机性,具有更高的检测重现性和稳定性。这使得Astral-DIA技术非常适合大批量样本的蛋白质组学分析。
技术路线
分析内容
分析流程图
1)数据质控;
2)差异蛋白筛选根据p value和FC筛选具有显著差异的蛋白;
3)火山图、聚类热图;
4)感兴趣蛋白的分布或表达的可视化展示;
5)GO、KEGG功能分析和通路分析,富集和差异蛋白改变相关的通路和功能进一步研究;
6) PPI分析等。
应用案例参考文献
1. Guzman, Ulises H et al. “Ultra-fast label-free quantification and comprehensive proteome coverage with narrow-window data-independent acquisition.” *Nature biotechnology* 10.1038/s41587-023-02099-7. 1 Feb. 2024
2. Dumas, Thibaut et al. “The astounding exhaustiveness and speed of the Astral mass analyzer for highly complex samples is a quantum leap in the functional analysis of microbiomes.” *Microbiome* vol. 12,1 46. 7 Mar. 2024
3. Heil, Lilian R et al. “Evaluating the Performance of the Astral Mass Analyzer for Quantitative Proteomics Using Data-Independent Acquisition.” *Journal of Proteome Research* (2024).