产品简介
10x Visium Cytassist是10x Genomics第一代Visium检测技术驱动的空间转录组。Visium技术的原始雏形被称为“空间转录组学”，最初由瑞典皇家理工学院的乔金·伦德伯格教授团队和生命科学实验室的科学家共同开发，2016年经10x Genomics收购该项技术并开发出了第一代10x Visium空间转录组，10x Visium Cytassist则是基于此开发出的第二代Visium空间转录组技术。
10x Visium CytAssist通过自动化探针转移技术，将标准载玻片上FFPE、冰冻包埋等多类组织切片的转录组信息精准捕获至Visium捕获玻片，无需预实验且操作简便，每次运行1小时内可处理至多两张切片，不仅降低样本质控要求，支持先染色选优质切片再分析，还提供多种捕获面积选择，全流程自动化集成使结果稳定可靠，大幅拓展了空间转录组研究的样本范围与应用场景。
左图：小鼠全脑FF样本；右图：人类肺癌FFPE样本
技术原理
10x Visium Cytassist空间转录组芯片采用点阵式阵列设计，由均匀排布的圆形捕获位点（spot）构成，单个spot直径为55μm，相邻spot中心间距为100μm【分辨率：100μm】；每个spot内部集成了针对目标物种的特异性寡核苷酸探针库，探针通过序列设计与样本中RNA分子精准互补结合，实现对不同基因转录本的特异性捕获
10x Visium Cytassist芯片设计图
检测流程
新鲜冷冻组织为例：样本经OCT包埋后，切10μm切片置于Visium玻片，H&E染色获取形态图；透化释放mRNA，与探针结合并原位反转录生成带空间条形码和UMI的cDNA；洗脱cDNA构建测序文库；测序分析后将表达数据映射到组织图像，得到空间转录组图谱。
10x Visium Ctyassist实验全流程
联川生物10x Visium Cytassist技术优势及特点
1.全转录本覆盖检测
联川生物10x Visium CytAssist技术采用全转录组捕获策略，可对组织切片内全部mRNA进行高效捕获，靶向性探针覆盖人、小鼠基因组中18000-20000个基因。依托探针特异性杂交，兼顾FF与FFPE样本，基因检出率高、数据稳定性强，能完整还原组织内基因表达全貌，为疾病机制、发育调控、肿瘤异质性等研究提供全面的转录本信息，满足深度挖掘与从头发现的需求。
2.与单细胞转录组反卷积整合
该技术可与单细胞转录组数据高效联动进行反卷积，借助Cell2location、SPOTlight等工具，将单细胞参考图谱映射到空间转录组位点，精准解析每个捕获区域的细胞类型组成与比例，实现“空间位置+细胞类型+基因表达”三维解析。
注：通过单细胞数据作为参考，解析空间转录组数据中每个spot的细胞类型组成（小鼠大脑），并根据细胞组成划分肿瘤区与非肿瘤区。
3.价格低于其他空间转录组平台
联川生物10x Visium CytAssist技术成本更可控，单位样本成本显著低于其他空间转录组平台，性价比突出。低门槛使之成为预实验首选，可快速验证课题可行性、筛选样本与条件。
4.多样化、个性化的分析流程
联川生物提供定制化空间转录组分析流程，从表达定量、空间聚类，到细胞类型反卷积、差异基因挖掘、空间共表达网络分析，均可按研究方向灵活调整。支持组织形态与表达数据联合可视化、肿瘤微环境等个性化分析模块，结合联川生物星云云平台实现交互式图表与在线可视化，快速产出符合高分期刊标准的分析结果，适配基础科研、临床转化、药物研发等不同场景。
5.5000+空间转录组样本处理经验
覆盖石蜡切片、冰冻组织、穿刺样本等多种样本类型，涵盖肿瘤、神经、免疫、自身免疫病等主流研究场景。从样本前处理、切片质控、探针杂交到空转检测与数据分析，全流程形成标准化、可重复的实验体系，有效保障数据稳定性与检出率，大幅降低批次差异与实验失败风险。依托成熟的技术平台与丰富的项目经验，可高效支撑从基础探索到大队列临床转化研究，为高质量空间多组学成果提供坚实的实验保障。
