产品介绍
10× Genomics Xenium原位空间转录组学研究可同时获取组织的精细空间结构与单细胞级别的空间基因表达信息,通过结合高分辨率显微成像、原位探针杂交与荧光解码技术,从完整的组织切片中精准捕获每个细胞的转录本数据,并将组织形态学特征与基因表达谱深度结合,通过原位数据分析流程实现基因表达与组织形态学数据的精准空间可视化。该技术可直接在单细胞分辨率下完成靶向基因的原位空间分析,实现组织切片的无间隙全区域覆盖,直接在组织切片上完成探针杂交与滚环扩增等原位反应。
Xenium 载玻片支持新鲜冷冻(FF)和石蜡包埋(FFPE)组织切片样本,通过多模态染色定义细胞边界,通过多轮荧光成像与解码完成转录本的空间定量、定位实现转录本的高灵敏度检测和高分辨率空间数据获取,充分保障基因表达信号的原位精准捕获。
技术原理
10x Xenium是基于挂锁式探针(Padlock Probe)+滚环扩增(RCA)+多轮荧光成像解码的原位空间转录组技术。核心是用针对mRNA设计的特异性挂锁探针识别靶RNA,两端匹配连接成环并经滚环扩增放大信号;再通过多轮“荧光探针杂交–成像–淬灭”,为每个RNA分子赋予独特荧光条形码,最终解码得到单细胞级别高分辨率的、原位的基因空间定位。
10x Xenium检测原理
检测流程
将组织切片放置在Xenium载玻片上,铺上特异性mRNA探针,探针在组织表面直接杂交结合mRNA分子。然后进行进行滚环扩增,扩大探针信号;接下来将Xenium载玻片放置到Xenium原位分析仪中进行荧光探针杂交、循环成像、解码和数据分析,从而在切片原位获得目标基因的转录组图谱;然后,通过对切片进行多模态染色,对每个细胞的边界进行区分。
10x Xenium实验全流程
联川生物10x Xenium技术优势和特点
根据最新发表的四篇高质量文章梳理和总结了Xenium、CosMx与MERFISH/MERSCOPE,目前市面上最主流的三大高分辨率空间转录组平台的性能差异,发现10x Xenium在技术参数、数据质量、临床适用性等方面都有着一定优势,是全面的“六边形战士”。
2.实验流程对组织样本的非破坏性
Xenium的实验流程对组织结构无破坏性,实验后组织仍可进行免疫荧光染色、病理分析等后续实验或其他空间组学检测,实现同层细胞、不同维度分子的相互整合,既解决了单组学数据的片面性,又提升了细胞分型与多维分子关联分析的可靠性,为解析复杂组织的细胞异质性提供了严谨的方法学支撑。
联川生物创新性实现同片10x Xenium+Akoya PCF空间单细胞蛋白质组检测
3.组织全覆盖检测
支持对载玻片上的整份组织样本进行无死角全景式检测,无需手动选择视场,彻底规避局部视场选择导致的组织区域遗漏问题,可完整捕捉组织整体的空间转录组信息,无论是肿瘤组织的异质区域还是正常组织的生理结构,都能实现全范围、高保真的信号捕获与解析,适配大组织样本及临床病理全片分析的研究需求。
4.原位靶向检测检测的高灵敏度和高特异性
组织原位的亚细胞分辨率,独特的探针设计(平均每个基因设计8对探针),增强了检测的灵敏性和特异性,结合原位显微成像的检测方法,保留RNA分子的原位特征,可以实现亚细胞的分辨率,精准识别罕见生物学特征。
5.亚细胞级超高清分辨率的空间转录组技术
具备亚细胞级超高分辨率,可精准捕捉RNA分子在细胞内的原位空间定位,清晰分辨亚细胞结构的基因表达差异,突破传统技术仅能实现细胞水平解析的局限,实现单分子级别的基因表达信号检测与定位,让基因表达的空间分布可视化更精细,为深入探究细胞微环境、亚细胞层面的分子调控机制提供高分辨率的空间转录组数据支撑。
6.多模态染色带来的精准细胞分割策略
使用多种染料对细胞核、细胞膜和细胞质进行染色,通过AI算法推断细胞边界,实现对不规则细胞形态的精准分割,分割效果更贴合真实的细胞形态,显著提升细胞识别、细胞注释和转录本归属判断的准确率,为后续分析提供可靠基础
7.检测通量高
10x Xenium原位空间转录组检测不依赖于测序芯片,检测面积较大【10.45mm x 24.45mm】,一次可同时检测两张玻片上机,还支持多样本拼片,大大提高了单次检测的样本量,提高了科研探索的容错率和准确性。
