空间组学

空间单细胞蛋白质组学PCF(CODEX)
  • 产品介绍
  • 案例展示
  • 结果展示
  • 常见问题
  • 送样建议

产品介绍

PhenoCycler-FusionPCF)是由Akoya Biosciences开发空间单细胞蛋白质组学检测平台,在CODEXCo-Detection by indEXing)的基础上进行了多项升级。PCF可在单张组织切片上实现单细胞级分辨率的100+种蛋白同步检测,突破了传统免疫荧光和免疫组化的通道限制,为精准解析组织微环境提供了强大的工具。

能够直接在蛋白质层面上对单个完整组织切片上绘制数百万个细胞,完成对组织微环境的表征提取,揭示细胞如何在整个组织景观中相互作用,有助于发现稀有细胞类型、分析细胞邻域和空间功能状态,深入解析肿瘤组织微环境、组织炎症微环境等。补充了传统空间转录组单一分子信息的片面性,为临床疾病研究提供了最为准确的蛋白质信息。

 

头颈鳞状细胞癌IO60Panel检测结果

 

技术原理

PhenoImager多重荧光免疫组化技术是一套多标记复染方案,允许在同一样本中使用同一种属来源的不同一抗进行多色标记,最多可实现89色荧光标记。同时,针对目标蛋白的检测抗体上偶联有一段带特定barcode序列的DNA链,可以和荧光报告探针上的DNA链互补从而被荧光探针识别。

 

Akoya PCF检测原理


检测流程

PCF的核心原理,是在检测中使用的每种抗体上都标记有特异性寡核苷酸“条形码标签”(Barcode)。成像所需的荧光染料上标记和抗体Barcode互补的特性性寡核苷酸序列。通过“染色-成像-移除荧光”自动化循环,在PCF平台上实现多达100种以上的蛋白指标的同时检测及分析,突破传统成像通道数量的限制

 

Akoya PCF实验全流程


联川生物Akoya PCF技术优势和特点

1.联川生物10x Xenium + Akoya PCF同片检测策略

基于10x Xenium检测的非破坏性以及蛋白质在临床研究中的重要性联川生物创新性开发出两种空间组学技术的同片检测策略,实现同层细胞多维分子的精准整合,为空间组学科研新范式提供了研究工具。

 


2.组织全覆盖成像

Akoya PCF通过无间隙、全组织成像策略,真正实现组织区域零遗漏、无盲区覆盖。其自动化循环成像系统可对整张切片进行连续、高分辨率扫描,在单细胞水平上实现全域空间蛋白组信息的无间隙解析,为精准刻画组织微环境、解析细胞空间排布规律提供真正意义上的全景式数据支撑。

 


3.空间单细胞分辨率的蛋白质检测

Akoya PCF可实现真正单细胞甚至亚细胞水平的原位空间蛋白质表达分析,其分辨率可达0.25μm,解决细胞组成在空间上的异质性。最多同时检测100+蛋白标记物,可在单细胞水平全面解析细胞表型异质性、功能状态及信号通路活性,显著提升对复杂生物学系统的解析深度。

 


4.高灵敏度、高特异性

依托抗体条形码标记与成像体系,Akoya PCF检测有效进行蛋白质的空间定位,大幅提升靶标与细胞的识别能力;同时严格控制非特异性结合与交叉干扰,在多重标记下仍保持高信噪比与高特异性,为空间蛋白组的精准定量与可靠分型提供坚实保障。

 

5.个性化的抗体Panel组合策略

Akoya PCF的检测Panel灵活,可根据自身科研需要对已有Panel中的抗体进行自由组合实现检测Panel的自定义

 


6.样本高通量检测

Akoya PCF空间单细胞蛋白质组检测不依赖于测序芯片,检测面积较大【18mm x 35mm】,支持多样本拼片,大大提高了单次检测的样本量,提高了科研探索的容错率和准确性。