产品简介
10x Genomics推出的Atera In Situ Platform新一代原位分析平台是在原有的超强性能Xenium In Situ平台上进一步重大升级，将空间原位检测推进到全转录本时代。检测通量、检测范围和检测精度是目前空间组学检测平台的三大发展方向，但往往三者不能兼顾。10x Atera首次实现了三大发展方向的协调统一：单次运行最多可检测4张芯片，全年共能实现约800+样本的全转录本检测，并延续了10x Xenium的单细胞分辨率和特异性，并在灵敏度方面进行了进一步提升。
通过结合高分辨率显微成像、原位探针杂交与荧光解码技术，从完整的组织切片中精准捕获每个细胞的转录组数据，并将组织形态学特征与基因表达谱深度结合，通过原位数据分析流程实现基因表达与组织形态学数据的精准空间可视化。该技术可直接在单细胞分辨率下完成全转录本的原位空间分析，实现组织切片的无间隙全区域覆盖，无需转录本转移步骤，直接在组织切片上完成探针杂交、链接与滚环扩增等原位反应。
10x Atera与10x Xenium相同，支持新鲜冷冻(FF)和石蜡包埋(FFPE)组织切片样本，通过多模态染色定义细胞边界，通过多轮荧光成像与解码完成转录本的空间定量、定位实现转录本的高灵敏度检测和高分辨率空间数据获取，充分保障基因表达信号的原位精准捕获。
技术原理
10x Atera是基于挂锁式探针（Padlock Probe）+滚环扩增（RCA）+多轮荧光成像解码的原位空间转录组技术。核心是用双端基因特异性挂锁探针识别靶RNA，仅两端完全匹配才连接成环并经RCA放大信号；再通过多轮“荧光探针杂交–成像–淬灭”，为每个RNA分子赋予独特荧光条形码，最终解码得到单分子级、高分辨率的基因空间定位。
检测流程
将组织切片放置在Xenium载玻片上,铺上特异性DNA探针，探针在组织表面直接杂交结合mRNA分子。然后进行进行滚环扩增（RCA），扩大探针信号；通过对切片进行多模态染色，对每个细胞的边界进行区分；最后，将Atera玻片放置到Atera In Situ Platform原位分析仪中进行荧光探针杂交、循环成像、解码和数据分析，从而在切片原位获得目标基因的转录组图谱。
联川生物10x Atera技术优势和特点
1.10x Atera全球首批合作商，10x Genomics全球单细胞及空间组学「优选合作商」
联川生物是10x Genomics在国内单细胞及空间组学最大的合作商、国内最大的10x空间组学检测平台、国内最大的10x Xenium空间转录组学检测平台之一、国内首个实现Xenium+PCF同片检测的公司、国内首个实现植物Xenium探针全定制（全球第二）且有文章Online的公司。
在原位空间组学检测上具有丰富的样本处理经验，已实现人和小鼠5000+各类型组织样本的实测上机，数据表现优异，其中不乏骨髓等疑难样本。项目经验丰富，欢迎各位老师前来咨询。
2.蛋白编码基因的全转录本覆盖
10x Atera在10x Xenium基础上实现了原位空间转录组的全转录本覆盖，总共涵盖了18000+蛋白编码基因，真正实现人类蛋白编码基因全景式原位检测，完整保留样本中全部转录本信息，大幅降低关键基因遗漏风险，尤其适用于未知机制探索、新发疾病研究、肿瘤异质性全景分析等场景。
除此之外，10x Atera还支持探针的额外定制与添加，最多可定制3000个靶基因探针(靶向TCR、BCR、SNP、LncRNA等)，不仅极大的拓宽了空间转录组的检测范围，还使得除人和小鼠之外的非模式物种的原位空间转录组检测成为可能。
3.检测灵敏精准、特异性强、重复性佳
10x Atera数据稳定性高，同样本多重复取样检出持续保持在较高水平且一致性强。此外，10x Atera与10x Single Cell Flex单细胞转录组数据表现出良好的一致性（R2=0.75），保证了单细胞+空间转录组联合分析的稳健性。不管是单次样本实验还是大队列研究，10x Atera既保证了数据的稳定可重复，又能满足研究目的的细致挖掘需求。
在灵敏度和特异性方面，10x Atera在延续了10x Xenium 5K高特异性的基础上，灵敏度再次实现2～3倍的倍增，进一步保证了整张切片上、单个细胞内的转录本检出数量和鉴定的基因数，为生物学问题的深入探索奠定了坚实的数据基础。
4.亚细胞级超高清分辨率的空间转录组技术
具备亚细胞级超高分辨率，可精准捕捉RNA分子在细胞内的原位空间定位，清晰分辨亚细胞结构的基因表达差异，突破传统技术仅能实现细胞水平解析的局限，实现单分子级别的基因表达信号检测与定位，让基因表达的空间分布可视化更精细，为深入探究细胞微环境、亚细胞层面的分子调控机制提供高分辨率的空间转录组数据支撑。
5.多模态染色带来的精准细胞分割策略
10x Atera沿用了10x Xenium的多模态染色策略，使用多种染料对细胞核、细胞膜和细胞质进行染色，通过AI算法推断细胞边界，实现对不规则细胞形态的精准分割，分割效果更贴合真实的细胞形态，显著提升细胞识别、细胞注释和转录本归属判断的准确率，为后续分析提供可靠基础。
6.更大芯片面积—更高检测通量
10x Atera原位空间全转录组检测采用全新高通量芯片设计，单张玻片有效成像面积超5cm²，可轻松适配超大组织切片与组织芯片检测需求；平台单次可同步运行4张玻片，总组织检测面积超2000mm²，样本通量较10x Xenium大幅提升。同时支持更灵活的多样本拼片与多区域联合检测，显著提升单次上机的样本处理量与实验效率，进一步降低批次差异，提升科研探索的容错率、数据稳定性与结果准确性，使2个科研项目的样本在1张芯片上完成检测成为可能，进一步提高了检测性价比。
